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国際宇宙ステーション（ISS）では、473日間も滞在しているアメリカ人医師デヴィッド・ジョーンダンを含め、6名の宇宙飛行士が活動していた。ある日、火星から帰還した無人探査機を回収した彼らは、火星の土壌から未知の微生物を発見する。それは彼らの予想を遙かに超えるスピードで成長し、高い知性も見せ始めると、クルーたちは世紀の大発見に興奮するのだった。

科学者とともにアルプス山脈で気象調査を行っている観測基地の管理人ヤネクたちは、ある日、観測機器故障の為に山の深くまで向かうと、氷河の一角が赤く染まっているのを発見する。変異した氷河の調査を始めた途端、狂犬病に感染したキツネが愛犬を襲い、治療の為に基地へ戻るも、突如彼らに未知の生命体が襲いかかる。なんとか生命体を撃退するが、ほどなくして赤く染まった氷河を分析した科学者から恐ろしい事実が告げられるのだった。

ニューヨークに暮らす高校生のピーター・パーカーは、トニー・スタークに見込まれ、彼が開発したスーツを着てスパイダーマンとして街を守っていた。そんな中、スタークに仕事を奪われたエイドリアン・トゥームスは、地球外の物質から強力な兵器を作り、ニューヨークを危機に陥れようとした。アベンジャーズに任せろとスタークの忠告を聞かず、一人前のヒーローに認めてもらおうとピーターは一人で立ち向かうのだった。

人類初の宇宙移住計画により二千人の入植者を乗せて宇宙船コヴェナント号は惑星オリガエー6を目指していた。ところが突然のアクシデントで船長が命を落としてしまい、その直後コヴェナント号は謎の電波を受信する。船長代理となったオラムは、亡くなった船長の妻であるダニエルズの反対を押し切り、進路を変更して電波の発信元近くの惑星へ向かうのだった。

ケーブルテレビ番組でホストを務めるダグは、無人島で五日間をたった一人で飲み物も食べ物もなくサバイバルするという企画を敢行する。しかし、自分しかいないはずの地で何か巨大なモノに抉られたような山肌、水面に広がる無数の魚の死体と突如現れた罠を見つける。ダグは耳鳴りがした瞬間、全身に強い衝撃を受けて隣の島まで吹っ飛ばされると、その前に現れたのは見た事もない生命体だった。

かつて有能な傭兵として活躍していたウェイド・ウィルソンは、ヒーロー気取りで悪いヤツらをこらしめ日銭を稼いでいた。ある日、娼婦のヴァネッサと出会い本当の愛を知り、結婚を決意した矢先、末期ガンである事を告げられる。そこでウェイドはある男に紹介された怪しげな治療を最後の望みとして被験者となる。だが、それは無敵の戦闘マシーンに改造する人体実験で、ウェイドはその副作用によって、マスクを被ってデッドプールとして生きる事を余儀なくされるのだった。

東京湾羽田沖で大量の水蒸気が噴出し、同時に海底を通る東京湾アクアラインでもトンネルの崩落事故が発生する。その原因は間もなく海上に現れた巨大生物の仕業だと知ると、急遽政府は「巨大不明生物特設災害対策本部」を設置。巨大生物は原子炉のような器官を備え、数年前から出現を予測していた日本人科学者の牧悟郎の残した資料から「ゴジラ」と巨大生物は命名されるのだった。

発明オタクの少年リード・リチャーズは小学校５年生で同級生のベン・グリムとともに物質転送装置を発明する。７年後、バクスター財団のストーム博士に見出され、彼の養女スー、息子ジョニー、研究者ヴィクターとともに本格的な転送装置を開発する。ベンも転送実験に参加し、異次元空間“プラネット・ゼロ”に転送されるも、思わぬ事故が起きてしまうのだった。

バツイチで無職のスコット・ラングは養育費も払えず、このままでは最愛の娘キャシーにも会えなくなってしまう。人生まさに崖っぷちのスコットは、ひょんな成り行きから天才科学者ハンク・ピム博士にある事を頼まれる。それはピム博士が開発した特殊なスーツを着て、わずか1.5㎝のスーパーヒーロー“アントマン”になるという事だった。