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アメリカ独立記念日前夜、ワシントンD.C.のFBI本部にある全米インフラ監視システムが何者かにハッキングされてしまう。FBI副局長のボウマンは犯人特定の為に全米のハッカーを保護する指令を出し、ジョン・マクレーンはマシュー・ファレルの連行中に襲撃される。最新のハイテクを駆使するトーマス・ガブリエル率いるサイバーテロ組織に対し、アナログ親父であるマクレーンはファレルと協力しながら反撃を開始するのだった。

ニューヨーク市内で爆弾テロが発生し、サイモンと名乗る男が休暇中だったジョン・マクレーンを指名した。マクレーンはサイモンの言われた通りに振り回されると、見かねた家電修理店のゼウスが声をかけた事で巻き込まれてしまう。サイモンは過去にマクレーンが殺したハンス・グルーバーの兄で、復讐を兼ねた銀行強盗に利用されるのだった。

ナカトミビルの事件から一年後のクリスマス、ワシントンのタレス空港で妻のホリーを出迎えに行っていたジョン・マクレーン。マクレーンは怪しい二人の男たちを追っていくと、職務質問したところで発泡され、相手がプロのテロリストだと判明する。空港関係者に事実を伝えるが誰にも信じてもらえず、またしても一人でテロリストを相手に単独で戦う事になるのだった。

ニューヨーク市警のジョン・マケレーン刑事は、クリスマス・イブにロサンゼルスで働く妻のホリーがいるナカトミ商事のハイテクビルへ向かう。華やかなクリスマス・パーティが行われる中、飛行機酔いしたマクレーンがトイレで休憩しているとビルは何者かの襲撃を受ける。ハンス・グルーバーが率いる強盗グループに警察が手をこまねいている間、マクレーンは妻を助ける為にたった一人で立ち向かうのだった。

ラクーンシティでの惨劇から数年後、T-ウイルスは世界に蔓延して、人類はアンデッドと化し、地上は砂漠へと化した。アンブレラ社ではアリス計画が始動し、アリスのクローンを用いた実験が繰り返される一方でオリジナルのアリスはクレアと行動するカルロスやＬ．Ｊ．たちと再会する。一行は楽園と呼ばれるアラスカへ向かう為、ラスベガスで食料と燃料を求めるが、そこにはアイザックス博士の寄越したスーパーアンデッドたちが待ち受けるのだった。

巨大企業アンブレラ社の地下研究所“ハイブ”の死闘から36時間後、何者かに捕らわれたアリスはラクーン・シティの病院で目覚める。病院を脱出したアリスだが、すでにその体は“T-ウイルス”が感染しているが、遺伝子レベルで共存して超人的な身体能力を発揮する。一方でT-ウイルスが流出したラクーンシティはアンデッドで埋め尽くされ、地元警察特殊部隊の女性隊員ジルは生存者たちと街の脱出を試みるのだった。

巨大企業アンブレラ・コーポレーションでは“ハイブ”と呼ばれる地下施設で研究中だったウイルスが何者かによって施設内にバラ撒かれ、レッド・クイーンによって完全封鎖される。内部調査の為に送り込まれた特殊部隊は、工作員であるアリスを見つけも、神経ガスの影響で記憶を失っていた。アリスと地元警察と自称するマット、地下を進む電車で気絶していたスペンスを加え、特殊部隊はハイブで恐ろしい光景を目にするのだった。

サイトBがジョン・ハモンドの尽力で恐竜の自然管理保護環境地区となり、同時に人間の立ち入り禁止されるも付近をパラセーリングした少年が遭難する。ジュラシック・パークでの事件で注目を集めるグラント博士だったが、本業の化石発掘の資金不足に問射る中でポール・カービーと出会う。妻との結婚記念日で恐竜を空から見たいという要望でガイドを依頼され、望む報酬を与えると聞いてグラント博士は島へ夫婦のガイドとして向かうのだった。

19世紀のヨーロッパ、バチカンの秘密組織から命を受け、世に蔓延るモンスターたちを退治し、彼らから恐れられるモンスター・ハンターのヴァン・ヘルシング。ヴァン・ヘルシングはある日、バチカンの密命を帯び、相棒で武器発明の天才である修道僧のカールとともに、怪物伝説の土地トランシルバニアに向かう。邪悪なパワーで世界征服を企むドラキュラ伯爵を抹殺するべく、ヴァン・ヘルシングは代々に渡って戦ってきた一族のヴァレリアスの末裔であるアナ王女に出会うのだった。