遼河はるひ

暴食のホムンクルス・グラトニーに飲み込まれてしまったエドたちは、ちょっとした思いつきの方法で脱出する事に成功した。そんな彼らの前にホーエンハイムとまったく同じ姿をした「お父様」と呼ばれる男が現れ、彼こそエルリック兄弟が戦ってきたホムンクルスの生みの親だと判明する。国家の秘密と「約束の日」やホーエンハイムの過去などの謎と真実が解き明かされる中、エドとアルは軍の暗部に立ち向かうマスタングやリンたちと陰謀を阻止していくのだった。